כן, על פי ההלכה, החיוב להפריש חלה נקבע לפי כמות הבצק הכוללת שהוכנה במאפייה, ולא לפי גודל המנה הנמכרת ללקוח בודד. לכן, גם אם כל לקוח מקבל כמות קטנה, המאפייה חייבת בהפרשה על כלל הבצק.
הפרשת חלה מתבצעת לאחר לישת הבצק ולפני אפייתו, כאשר הבצק הגיע למסה המחייבת. במאפייה, יש להקפיד לבצע את ההפרשה על כלל הבצק שהוכן לפני חלוקתו ליחידות קטנות יותר.
האחריות ההלכתית להפרשת חלה מוטלת על בעל המאפייה, כיוון שהוא בעל הבצק. עם זאת, הוא יכול למנות שליח מטעמו, כמו עובד ירא שמיים, לבצע את ההפרשה בפועל.