ספק מעשר עני מתייחס למצב של אי-ודאות הלכתית לגבי חובת הפרשת מעשר עני מפירות או ירקות מסוימים. ספק זה יכול לנבוע ממגוון סיבות, כגון חוסר ידיעה על מקור התוצרת או על הפרשות קודמות שנעשו.
בית המדרש להלכה בהתישבות מציע שירותי הכוונה הלכתית באמצעות בית ההוראה שלו. ניתן גם להשתמש בשירות "שאל את הרב" באתר כדי לקבל מענה לשאלות ספציפיות בנושא ספק מעשר עני.
קרן המעשרות מסייעת בהפרשה מסודרת של תרומות ומעשרות ובכך יכולה למנוע ספקות מלכתחילה. במקרים של ספק קיים, מומלץ לפנות לבית ההוראה של המכון לקבלת הכוונה פרטנית.